La sfârşitul lunii iulie, APDRP anunţa că este obligată ca începând cu 1 august 2006 să sisteze primirea cererilor de finanţare pentru proiectele SAPARD, ca urmare a depăşirii fondurilor alocate României prin acest program. În acel moment, existau solicitări de finanţare de 1,63 de miliarde de euro, mai mari comparativ cu fondurile de 1,5 miliarde de euro alocate pentru SAPARD.
În luna noiembrie, s-au mai alocat fonduri SAPARD doar pentru două măsuri suma disponibilă pentru acestea fiind de 18.936.826 de euro.
Numărul proiectelor depuse în 2006 pentru cofinanţare SAPARD a crescut cu 56,3%, comparativ cu cele primite în perioada 2000-2005. Astfel, în 2006, au fost depuse 3.985 de proiecte în valoare de 1,09 miliarde de euro, în timp ce de la debutul proiectului SAPARD până la sfârşitul anului 2005, s-au primit 2.570 de proiecte.
Confruntaţi cu un număr mare de proiecte reprezenţii APDRP au anunţat, la sfârşitul lunii noiembrie, că au solicitat Comisiei Europene prelungirea cu doi ani a termenului de efectuare a plăţilor, fiind în imposibilitatea de a finaliza plăţile aferente anului 2004.
Regula programului SAPARD spune că plăţile aferente anumitor proiecte trebuie făcute în maxim doi ani de la contractarea acestora. Prin urmare, la sfârşitul anului 2006, Agenţia de Plăţi pentru Dezvoltare Rurală şi Pescuit (APDRP) trebuia să efectueze plăţi pentru Acordul de Finanţare Anuală 2004.
Pentru programul SAPARD România a primit 1, 5 miliarde de euro,din care nu a reuşit să cheltuie decât 655,6 milioane de euro. Diferenţa trebuie utilizată până în 2008, dată la care se finalizează programul SAPARD.
