Pentru 2012 bugetul estimat al instituţiei este de 1,185 miliarde lei (0,2% din PIB), se arată în strategia fiscală aprobată de Guvern pentru perioada 2011-2013, obţinută de MEDIAFAX.

În 2008 şi 2009 bugetul Ministerului Economiei a fost de 407 milioane lei (0,08% din PIB), respectiv 728 milioane lei (0,15% din PIB).

Bugetul instituţiei pentru perioada 2011-2013 este estimat să fie alimentat în principal din surse externe nerambursabile postaderare.