Surse judiciare au declarat pentru Money TV că în perioada 2006 – 2007 Frățilă a fost și în vizorul procurorilor români de la DIICOT. În dosarul din România el a fost în cele din urmă scos de sub urmărire penală. Era cercetat pentru infracțiuni la legea siguranței naționale după ce ar fi folosit nu tocmai corect o serie de informații clasificate.
În ceea ce privește afacerile sale pentru care a intrat în atenția autorităților judiciare din SUA, anchetatorii americani au descoperit încă din 2006 că acesta avea legături cu un general de aviație iranian de rang foarte înalt, Jamshid Ghassemi. Acesta a fost arestat în noiembrie 2006 în Bangkok, Thailanda, pentru conspirație împotriva SUA.
Potrivit Los Angeles Times, în septembrie 2008 autoritățile judiciare din Thailanda l-au eliberat din arest pe Ghassemi, respingând totodată cererea SUA de extrădare a acestuia. Purtătorul de cuvânt al Parchetului Curții de Apel București a confirmat pentru Money TV că SUA a făcut cerere de extrădare pentru Aurel Frățilă ca urmare a faptului că acesta a încălcat legea americană referitoare la exportul de echipamente militare.
Împotriva lui Ghassemi și Frățilă judecătorii americani au pornit un proces penal încă din 2006 aceștia fiind acuzați că au dorit să exporte în Iran, via România, produse militare americane, fără licență din partea Departamentului de Stat din SUA. Mai exact este vorba de niște giroscoape și accelerometre militare necesare în cazul sistemelor de ghidare a rachetelor balistice.
Decizia Curţii de Apel Bucureşti în cazul lui Aurel Fraţilă
